По среде обитания вирусы можно разделить на сетевые, файловые и загрузочные.
Сетевые вирусы распространяются по компьютерной сети,
файловые внедряются в выполняемые файлы,
загрузочные - в загрузочный сектор диска (Boot-сектор) или в сектор, содержащий системный загрузчик винчестера (Master Boot Record). Существуют сочетания - например, файлово-загрузочные вирусы, заражающие как файлы, так и загрузочные сектора дисков. Такие вирусы, как правило, имеют довольно сложный алгоритм работы и часто применяют оригинальные методы проникновения в систему.